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E1The Night The Clown Cried
水晶灣遭受到愛哭小丑的攻擊，而薛吉和他的同伴們都分散各處。水晶灣新任市長聽取建議想要求助於神秘檔案部隊，於是薛吉的同伴們都一一的被找回來。此時發現戴芬有新歡，弗列德極度傷心，不過還是深信她會回到團隊。這時愛哭小丑對水晶灣市長提出了要求，付錢
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E2House Of The Nightmare Witch
弗列德回到了水晶灣高中但他還沒有忘記前女友戴芬。由於之前他們的離開葳瑪似乎跟E先生有合作關係，而葳瑪的朋友熱狗水似乎也沒有他們想像的單純。這時水晶灣港口出現了一艘載有俄羅斯民俗文物展覽品東西的貨船。但是接踵而來的怪事讓神秘部隊的人不禁懷疑跟
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E3The Night The Clown Cried II: Tears Of Doom
之前襲擊水晶灣的愛哭小丑又再次回來了，只不過不同於往常，這次愛哭小丑不再到處襲擊建築物或是無辜居民。而是選擇一些特定職業的人將他們綁架，由於弗列德還陷在失去戴芬的失落感中，薛吉叔比又搞不太清楚狀況，神秘檔案部隊就只剩葳瑪跟熱狗水一一的去找尋
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E4Web Of The Dreamweaver
戴芬歸隊後，可想而知熱狗水就被排除了。水晶灣這時又出現了會入侵人的夢中的捕夢者。E先生這時又出來擾亂葳瑪的心思。奇怪的是，捕夢者不是入侵所有人的夢，而是那些曾經是怪獸與地窖的玩家，他們的夢才會被捕夢者入侵，捕夢者主要目的都是要奪走這些人最珍
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E5The Hodag Of Horror
A traveling curio wagon arrives in Crystal Cove, and a carnie-barker by the name of Gene Shepherd unveils the Hodag, a b
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E6Art Of Darkness
World-renowned artist Randy Warsaw is Crystal Cove's greatest art treasure. When Warsaw's greatest artwork, "Junk" comes
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E7The Gathering Gloom
水晶灣今晚有個恐怖電影之夜，沒想到電影裡的食屍鬼竟然從電影出現在現實生活中。神秘案部隊這時出現不同意見，葳瑪決的掘墓者艾法蘿是主使者，但弗列德覺得不是。當他們正要展開調查時，大家又都被默德 比喬克美麗的女兒們跟他家的美食所誘惑了，於是只剩下
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E8Night On Haunted Mountain
神秘檔案部隊的高中同學們蓋瑞跟伊森，因為聽信某些謠言，而跑到了代不拉山去段練腳力，但是在途中遭受到暗黑莉莉斯的攻擊，導致兩人受傷。這時，神秘檔案部隊決定要去解決這一謎團，一群人來到了蠍子井，這裡的居民個個都很怪異，讓人有點害怕，居民們對代不
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E9Grim Judgement
神秘清教徒哈貝德 葛林在水晶灣到處攻擊漂亮妹妹，長得特別漂亮的或是穿著亮眼的，都會受到審判威脅，市長甚至也在其中。神秘檔案部隊的高中同學蓋瑞，在每次的攻擊事件都剛好恰巧在現場，為何會這麼剛好，忍不住讓人懷疑事情沒有那麼單純。於是他們開始展開
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E10Night Terrors
神秘檔案部隊好不容易在經歷這麼多事情後，有機會去度假.沒想到在路上，遇到了大風雪，於是他們的神奇萬能車居然出了問題。這時只好去布林頓豪宅圖書館借住一晚，但奇怪的是,在這裡他們每個人都出現了幻覺，大家都看到了恐怖的怪獸。後來追根究底才發現，原
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E11The Midnight Zone
When the DJ at the local radio station, K-GHOUL is attacked, the gang investigates.
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E12Scarebear
狄士多公司似乎在水晶灣造成不小的汙染。這時在污染嚴重區域的地方又出現了一隻突變的恐怖熊，原本大家以為是喬治 阿瓦卡多所假扮的，但他也是汙染的受害者之一。E 先生為了取得其他三份的星座圖，開始對神秘檔案部隊採取一些手段，想要把他們滅口，這樣他
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E13Wrath Of The Krampus
在得知神秘檔案部隊也同樣有三份座圖後，派瑞克里教授積極的想要拿到他們那三份。這時E 先生耳聞是弗列德負責保管星座圖的，於是要茱蒂與布萊德想辦法從他們兒子那裡偷走。此時，又出現了德國民俗故事中的嚇小孩的怪獸卡蘭普斯，他們以為這樣就可以讓神秘檔
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E14The Heart Of Evil
水晶灣出現了奇怪的機械狗（戴諾馬）跟裝扮成鳥的男子（藍獵鷹），他們是為了追尋一隻機械龍而來到了水晶灣，恰巧這隻龍似乎常常鬼鬼祟祟的在E 先生的狄士多工廠搜集資料。這時候神秘檔案部隊跟藍獵鷹一起想辦法要解決這謎團時，辛博士跟著龍一起現身，將藍
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E15Theater Of Doom
Life imitates art in Crystal Cove's annual Haunted Historical Pageant.
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E16Aliens Among Us
就在神秘檔案部隊的大家正在討論星座圖的事情，史東警長慌慌張張地跑進來說他被外星人綁架了，大家這時都一頭霧水，但是警長說的繪聲繪影的，於是神秘檔案部隊的大家都決定要幫警長查清楚。就在他們搞不清楚狀況時，轉向對外星生物事蹟有研究的丁克利太太請求
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E17The Horrible Herd
看似平靜的水晶灣這時農場紛紛被奇怪的骷顱牛群攻擊，這些骷顱牛群不只是會攻擊所有看到的東西還會將所有的東西吞掉，讓所有的農夫們都非常的頭痛。這時神秘檔案部隊開始到各個農場去找尋線索，發現這些牛群除了長相奇特之外，破壞農場時沿路還會留下一種甜甜
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E18Dance Of The Undead
正當神秘檔案部隊準備要繼續研究星座圖時，又出現了奇怪的傳聞。新聞報導有一個三十年前過世的搖滾樂團主唱壞男孩又開始表演，而且還帶來奇怪的殭屍瘟疫。令人覺得詭異的是，去世三十年的人為什麼會突然又復活了呢？這之中必有未解開的謎團。神秘檔案部隊便接
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E19The Devouring
神秘檔案部隊找到星座圖後發覺星座圖似乎又要帶領他們去發現不同的秘密，而此時他們所遇到的謎團都不合一般常理，讓大家都非常的疑惑但又不知道解答。此時出現了一隻專們吃澱粉類食物的澱粉魔，據說他會一直吃一直吃直到把所有可吃的食物都吃完，讓小鎮的人間
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E20Stand And Deliver
平靜的水晶灣這時突然出現了一位詭異的大盜，除了搶劫財物還會將隨行的女士一併帶走，奇怪的是，這些女士不是被硬硬綁架的，而都是心甘情願的跟著這位大盜一起走。而隨著消失的女士們越來越多，神秘檔案部隊這時就開始著手調查，沒想到水晶灣的妮特市長也被同
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E21The Man In The Mirror
神秘檔案部隊突然接到了妮特市長的電話，說有怪聲打擾附近民眾。當神秘檔案部隊調查之後，發現原來是一隻小貓，但奇怪的是，弗列德之後的行為舉止都變得怪怪的，讓其他的人都匪夷所思，不知道發生什麼事，這個怪怪的弗列德又一直問星座圖的事情。聰明的弗列德
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E22Nightmare In Red
連續的噩夢讓叔比狗睡覺都不得安寧，這時夢中出現了一位人物卡隆博士，這位催眠大師跟神祕學專家跟葳瑪在讀的書的作者正好是同一人。於是，這時候神秘檔案部隊準備去拜訪這位教授，畢竟這是他們唯一的線索來源。一開始博士不想見客，但是後來聽到叔比在他的夢
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E23Dark Night Of The Hunters
神秘檔案部隊為了找到豹之心來毀滅邪惡的勢力，請出葳瑪的媽媽丁克利太太來協助他們，恰巧她有朋友是開古董店的，於是丁克利太太就請他協助來找尋豹之心。正當快接近目標的時候，這位友人不幸的被叢林神廟的女祭司抓走了，於是神秘檔案部隊也啟程到叢林去一探
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E24Gates Of Gloom
正當神秘檔案部隊高高興興地拿著豹之心長矛準備去解決水晶灣危機時，到達時卻發現地底似乎有變化，水晶灣的居民全部都被拉到地下去了。於是他們跟著線索，一步步地找，原來是派瑞克里教授在搞鬼，因為他拿到了星座圖，又知道通往邪惡實體的入口在哪裡。因此他
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E25Through The Curtain
就在神秘檔案部隊跟著派瑞克里教授一群人進到洞穴裡，他們以為派瑞克里教授不知道，但事實上這一切都已經在派瑞克里教授的預期中。當他們到達第一扇門時，派瑞克里教授為了引誘他們出來，於是把熱狗水抓來當人質，威脅他們要他們投降。果然他的詭計成功了，但
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E26Come Undone
豹之心原來無法摧毀邪惡實體，正當邪惡實體要叔比狗犧牲自己來補強他的體力時，派瑞克里教授這時自告奮勇的說，他願意犧牲。邪惡實體為了增強精力，不斷的吞噬他見到的每個人。神秘檔案部隊也差點慘遭魔掌，幸好在緊要關頭E 先生不知道是見義勇為，還是良心
